Za obavljanje poslova iz delokruga Ministarstva obrazuju se osnovne unutrašnje jedinice:
1. Sektor za pravosuđe;
2. Sektor za evropske integracije i međunarodne projekte;
3. Sektor za normativne poslove;
4. Sektor za materijalno-finansijske poslove;
5. Sektor za međunarodnu saradnju i strateško planiranje
U Ministarstvu se obrazuju posebne unutrašnje jedinice:
1. Sekretarijat Ministarstva i
2. Kabinet
U Ministarstvu se obrazuju sledeće uže unutrašnje jedinice, izvan sektora i Sekretarijata:
1. Grupa za nadzor nad tajnošću podataka;
2. Odsek za internu reviziju;
Određene poslove iz delokruga Ministarstva obavlja i samostalni izvršilac izvan svih unutrašnjih jedinica.
