Управа за сарадњу с црквама и верским заједницама врши стручне послове који се односе на:
- афирмацију и развој слободе вероисповедања;
- сарадњу државе са црквама и верским заједницама и унапређење њиховог положаја у друштву;
- афирмисање верских основа и садржаја српског националног идентитета;
- помоћ у заштити верских компонената у културном и етничком идентитету националних мањина;
- поклоничка путовања, ходочашће и друге облике верског туризма;
- сарадњу државе са епархијама Српске православне цркве у иностранству;
- развој и афирмисање вредности религијске културе;
- подршку развоју верског образовања и помоћ при укључивању у систем образовања;
- пружање подршке и помоћи при сакралном градитељству и заштити црквеног културног наслеђа;
- пружање помоћи у заштити правног и друштвеног положаја цркава и верских заједница, остваривању њихових законом утврђених права, уређивању и побољшању социјално-материјалног положаја носилаца вере (свештеномонаштво, верски службеници, ђаци и студенти верских школа).
За обављање послова из делокруга Управе, образују се следеће основне унутрашње јединице:
1. Сектор за унапређење положаја цркава и верских заједница и међународну сарадњу;
2. Сектор за правне, финансијске и опште послове
У Сектору за унапређење положаја цркава и верских заједница и међународну сарадњу, образују се ужа унутрашња јединица Одељење за сарадњу с црквама и верским заједницама.
У Сектору за правне, финансијске и опште послове, образују се следеће уже унутрашње јединице:
1. Група за правне и опште послове;
2. Група за финансијске и рачуноводствене послове
